El MAPI realiza paralelamente a las exhibiciones otras actividades complementarias de divulgación. Un propósito básico de la gestión de este museo ha sido el fortalecimiento de los vínculos entre la universidad, las instituciones de enseñanza primaria y secundaria y el Museo, promoviendo una difusión amplia de las investigaciones realizadas en seminarios, charlas, talleres y conferencias. Así como también actividades recreativas que promuevan el conocimiento y la valoración del arte precolomino, indígena y otras expresiones asociadas.

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